Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPR3

TYW3, tRNA wybutosine-synthesizing protein 3 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYW3Q6IPR3 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TYW3Q6IPR3 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TYW3Q6IPR3 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TYW3Q6IPR3 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TYW3Q6IPR3 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TYW3Q6IPR3 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TYW3Q6IPR3 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TYW3Q6IPR3 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TYW3Q6IPR3 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TYW3Q6IPR3 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TYW3Q6IPR3 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TYW3Q6IPR3 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TYW3Q6IPR3 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TYW3Q6IPR3 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TYW3Q6IPR3 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TYW3Q6IPR3 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TYW3Q6IPR3 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TYW3Q6IPR3 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TYW3Q6IPR3 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TYW3Q6IPR3 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TYW3Q6IPR3 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TYW3Q6IPR3 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TYW3Q6IPR3 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TYW3Q6IPR3 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TYW3Q6IPR3 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TYW3Q6IPR3 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TYW3Q6IPR3 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TYW3Q6IPR3 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TYW3Q6IPR3 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TYW3Q6IPR3 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TYW3Q6IPR3 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TYW3Q6IPR3 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TYW3Q6IPR3 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TYW3Q6IPR3 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TYW3Q6IPR3 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TYW3Q6IPR3 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TYW3Q6IPR3 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TYW3Q6IPR3 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TYW3Q6IPR3 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TYW3Q6IPR3 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TYW3Q6IPR3 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TYW3Q6IPR3 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TYW3Q6IPR3 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TYW3Q6IPR3 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TYW3Q6IPR3 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TYW3Q6IPR3 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TYW3Q6IPR3 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TYW3Q6IPR3 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TYW3Q6IPR3 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TYW3Q6IPR3 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TYW3Q6IPR3 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TYW3Q6IPR3 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TYW3Q6IPR3 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TYW3Q6IPR3 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TYW3Q6IPR3 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TYW3Q6IPR3 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TYW3Q6IPR3 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TYW3Q6IPR3 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TYW3Q6IPR3 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TYW3Q6IPR3 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TYW3Q6IPR3 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TYW3Q6IPR3 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TYW3Q6IPR3 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TYW3Q6IPR3 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TYW3Q6IPR3 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TYW3Q6IPR3 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TYW3Q6IPR3 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TYW3Q6IPR3 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TYW3Q6IPR3 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TYW3Q6IPR3 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TYW3Q6IPR3 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TYW3Q6IPR3 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TYW3Q6IPR3 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TYW3Q6IPR3 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TYW3Q6IPR3 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TYW3Q6IPR3 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TYW3Q6IPR3 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TYW3Q6IPR3 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TYW3Q6IPR3 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TYW3Q6IPR3 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TYW3Q6IPR3 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TYW3Q6IPR3 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TYW3Q6IPR3 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TYW3Q6IPR3 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TYW3Q6IPR3 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TYW3Q6IPR3 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TYW3Q6IPR3 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TYW3Q6IPR3 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TYW3Q6IPR3 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TYW3Q6IPR3 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TYW3Q6IPR3 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TYW3Q6IPR3 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TYW3Q6IPR3 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TYW3Q6IPR3 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TYW3Q6IPR3 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TYW3Q6IPR3 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TYW3Q6IPR3 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TYW3Q6IPR3 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TYW3Q6IPR3 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TYW3Q6IPR3 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.9 ms