Protein–RNA interactions for Protein: Q6IC98

GRAMD4, GRAM domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD4Q6IC98 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GRAMD4Q6IC98 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GRAMD4Q6IC98 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GRAMD4Q6IC98 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GRAMD4Q6IC98 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GRAMD4Q6IC98 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GRAMD4Q6IC98 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GRAMD4Q6IC98 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GRAMD4Q6IC98 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GRAMD4Q6IC98 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
GRAMD4Q6IC98 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GRAMD4Q6IC98 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
GRAMD4Q6IC98 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GRAMD4Q6IC98 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GRAMD4Q6IC98 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GRAMD4Q6IC98 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GRAMD4Q6IC98 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GRAMD4Q6IC98 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GRAMD4Q6IC98 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GRAMD4Q6IC98 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GRAMD4Q6IC98 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GRAMD4Q6IC98 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GRAMD4Q6IC98 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GRAMD4Q6IC98 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GRAMD4Q6IC98 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GRAMD4Q6IC98 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GRAMD4Q6IC98 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GRAMD4Q6IC98 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GRAMD4Q6IC98 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GRAMD4Q6IC98 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GRAMD4Q6IC98 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GRAMD4Q6IC98 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GRAMD4Q6IC98 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GRAMD4Q6IC98 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GRAMD4Q6IC98 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GRAMD4Q6IC98 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GRAMD4Q6IC98 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GRAMD4Q6IC98 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GRAMD4Q6IC98 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GRAMD4Q6IC98 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
GRAMD4Q6IC98 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GRAMD4Q6IC98 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GRAMD4Q6IC98 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GRAMD4Q6IC98 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GRAMD4Q6IC98 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GRAMD4Q6IC98 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GRAMD4Q6IC98 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GRAMD4Q6IC98 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GRAMD4Q6IC98 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GRAMD4Q6IC98 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GRAMD4Q6IC98 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GRAMD4Q6IC98 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GRAMD4Q6IC98 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GRAMD4Q6IC98 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GRAMD4Q6IC98 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GRAMD4Q6IC98 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GRAMD4Q6IC98 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GRAMD4Q6IC98 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GRAMD4Q6IC98 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GRAMD4Q6IC98 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GRAMD4Q6IC98 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GRAMD4Q6IC98 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
GRAMD4Q6IC98 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GRAMD4Q6IC98 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GRAMD4Q6IC98 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GRAMD4Q6IC98 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GRAMD4Q6IC98 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GRAMD4Q6IC98 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GRAMD4Q6IC98 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GRAMD4Q6IC98 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GRAMD4Q6IC98 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GRAMD4Q6IC98 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GRAMD4Q6IC98 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
GRAMD4Q6IC98 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GRAMD4Q6IC98 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GRAMD4Q6IC98 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GRAMD4Q6IC98 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GRAMD4Q6IC98 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GRAMD4Q6IC98 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GRAMD4Q6IC98 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GRAMD4Q6IC98 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GRAMD4Q6IC98 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
GRAMD4Q6IC98 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
GRAMD4Q6IC98 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GRAMD4Q6IC98 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GRAMD4Q6IC98 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GRAMD4Q6IC98 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GRAMD4Q6IC98 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GRAMD4Q6IC98 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GRAMD4Q6IC98 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GRAMD4Q6IC98 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GRAMD4Q6IC98 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GRAMD4Q6IC98 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GRAMD4Q6IC98 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GRAMD4Q6IC98 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GRAMD4Q6IC98 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GRAMD4Q6IC98 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GRAMD4Q6IC98 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GRAMD4Q6IC98 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GRAMD4Q6IC98 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms