Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT06

CEP350, Centrosome-associated protein 350, humanhuman

Predictions only

Length 3,117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP350Q5VT06 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CEP350Q5VT06 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CEP350Q5VT06 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CEP350Q5VT06 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CEP350Q5VT06 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CEP350Q5VT06 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CEP350Q5VT06 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CEP350Q5VT06 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CEP350Q5VT06 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CEP350Q5VT06 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CEP350Q5VT06 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CEP350Q5VT06 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CEP350Q5VT06 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CEP350Q5VT06 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CEP350Q5VT06 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CEP350Q5VT06 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CEP350Q5VT06 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CEP350Q5VT06 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CEP350Q5VT06 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CEP350Q5VT06 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CEP350Q5VT06 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CEP350Q5VT06 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CEP350Q5VT06 C18orf21-202ENST00000333234 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CEP350Q5VT06 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CEP350Q5VT06 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CEP350Q5VT06 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CEP350Q5VT06 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CEP350Q5VT06 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CEP350Q5VT06 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CEP350Q5VT06 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CEP350Q5VT06 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CEP350Q5VT06 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CEP350Q5VT06 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CEP350Q5VT06 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CEP350Q5VT06 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CEP350Q5VT06 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CEP350Q5VT06 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CEP350Q5VT06 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CEP350Q5VT06 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CEP350Q5VT06 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CEP350Q5VT06 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CEP350Q5VT06 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CEP350Q5VT06 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CEP350Q5VT06 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CEP350Q5VT06 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CEP350Q5VT06 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CEP350Q5VT06 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CEP350Q5VT06 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CEP350Q5VT06 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CEP350Q5VT06 IGKV1OR-2-201ENST00000457995 350 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CEP350Q5VT06 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CEP350Q5VT06 AC007656.1-201ENST00000552238 573 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CEP350Q5VT06 AC009093.2-201ENST00000563477 546 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CEP350Q5VT06 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CEP350Q5VT06 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CEP350Q5VT06 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CEP350Q5VT06 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CEP350Q5VT06 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CEP350Q5VT06 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CEP350Q5VT06 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CEP350Q5VT06 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CEP350Q5VT06 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CEP350Q5VT06 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CEP350Q5VT06 MACROD2-204ENST00000407045 727 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CEP350Q5VT06 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CEP350Q5VT06 IFI35-204ENST00000438323 1232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CEP350Q5VT06 GTF2I-203ENST00000443166 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CEP350Q5VT06 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CEP350Q5VT06 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CEP350Q5VT06 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CEP350Q5VT06 C11orf1-202ENST00000528125 534 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CEP350Q5VT06 HIST2H2BF-204ENST00000545683 999 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CEP350Q5VT06 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CEP350Q5VT06 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CEP350Q5VT06 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CEP350Q5VT06 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CEP350Q5VT06 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CEP350Q5VT06 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CEP350Q5VT06 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CEP350Q5VT06 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CEP350Q5VT06 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CEP350Q5VT06 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CEP350Q5VT06 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CEP350Q5VT06 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CEP350Q5VT06 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CEP350Q5VT06 NAA38-205ENST00000575771 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CEP350Q5VT06 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CEP350Q5VT06 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CEP350Q5VT06 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CEP350Q5VT06 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CEP350Q5VT06 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CEP350Q5VT06 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CEP350Q5VT06 AC107463.1-201ENST00000508605 667 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CEP350Q5VT06 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CEP350Q5VT06 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CEP350Q5VT06 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CEP350Q5VT06 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CEP350Q5VT06 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CEP350Q5VT06 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CEP350Q5VT06 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms