Protein–RNA interactions for Protein: Q5QGS0

NEXMIF, Neurite extension and migration factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEXMIFQ5QGS0 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEXMIFQ5QGS0 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NEXMIFQ5QGS0 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NEXMIFQ5QGS0 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEXMIFQ5QGS0 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEXMIFQ5QGS0 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEXMIFQ5QGS0 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEXMIFQ5QGS0 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEXMIFQ5QGS0 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEXMIFQ5QGS0 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEXMIFQ5QGS0 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEXMIFQ5QGS0 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEXMIFQ5QGS0 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEXMIFQ5QGS0 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEXMIFQ5QGS0 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEXMIFQ5QGS0 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEXMIFQ5QGS0 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEXMIFQ5QGS0 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEXMIFQ5QGS0 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEXMIFQ5QGS0 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEXMIFQ5QGS0 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NEXMIFQ5QGS0 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEXMIFQ5QGS0 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEXMIFQ5QGS0 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEXMIFQ5QGS0 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NEXMIFQ5QGS0 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEXMIFQ5QGS0 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEXMIFQ5QGS0 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NEXMIFQ5QGS0 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEXMIFQ5QGS0 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEXMIFQ5QGS0 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEXMIFQ5QGS0 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEXMIFQ5QGS0 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEXMIFQ5QGS0 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEXMIFQ5QGS0 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEXMIFQ5QGS0 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEXMIFQ5QGS0 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEXMIFQ5QGS0 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEXMIFQ5QGS0 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEXMIFQ5QGS0 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NEXMIFQ5QGS0 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEXMIFQ5QGS0 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEXMIFQ5QGS0 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEXMIFQ5QGS0 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEXMIFQ5QGS0 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEXMIFQ5QGS0 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEXMIFQ5QGS0 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEXMIFQ5QGS0 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEXMIFQ5QGS0 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEXMIFQ5QGS0 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEXMIFQ5QGS0 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEXMIFQ5QGS0 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEXMIFQ5QGS0 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEXMIFQ5QGS0 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NEXMIFQ5QGS0 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEXMIFQ5QGS0 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEXMIFQ5QGS0 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NEXMIFQ5QGS0 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEXMIFQ5QGS0 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEXMIFQ5QGS0 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEXMIFQ5QGS0 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEXMIFQ5QGS0 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEXMIFQ5QGS0 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEXMIFQ5QGS0 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NEXMIFQ5QGS0 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEXMIFQ5QGS0 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEXMIFQ5QGS0 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEXMIFQ5QGS0 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEXMIFQ5QGS0 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEXMIFQ5QGS0 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEXMIFQ5QGS0 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEXMIFQ5QGS0 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEXMIFQ5QGS0 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NEXMIFQ5QGS0 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEXMIFQ5QGS0 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEXMIFQ5QGS0 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEXMIFQ5QGS0 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEXMIFQ5QGS0 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEXMIFQ5QGS0 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEXMIFQ5QGS0 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEXMIFQ5QGS0 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEXMIFQ5QGS0 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEXMIFQ5QGS0 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEXMIFQ5QGS0 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEXMIFQ5QGS0 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEXMIFQ5QGS0 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEXMIFQ5QGS0 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEXMIFQ5QGS0 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEXMIFQ5QGS0 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEXMIFQ5QGS0 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEXMIFQ5QGS0 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEXMIFQ5QGS0 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEXMIFQ5QGS0 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NEXMIFQ5QGS0 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEXMIFQ5QGS0 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NEXMIFQ5QGS0 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEXMIFQ5QGS0 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEXMIFQ5QGS0 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEXMIFQ5QGS0 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEXMIFQ5QGS0 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms