Protein–RNA interactions for Protein: Q5K4L6

SLC27A3, Long-chain fatty acid transport protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 730 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A3Q5K4L6 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC27A3Q5K4L6 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC27A3Q5K4L6 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC27A3Q5K4L6 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC27A3Q5K4L6 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC27A3Q5K4L6 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC27A3Q5K4L6 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC27A3Q5K4L6 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC27A3Q5K4L6 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC27A3Q5K4L6 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC27A3Q5K4L6 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC27A3Q5K4L6 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC27A3Q5K4L6 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC27A3Q5K4L6 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC27A3Q5K4L6 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC27A3Q5K4L6 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC27A3Q5K4L6 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC27A3Q5K4L6 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC27A3Q5K4L6 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC27A3Q5K4L6 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC27A3Q5K4L6 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC27A3Q5K4L6 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC27A3Q5K4L6 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC27A3Q5K4L6 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC27A3Q5K4L6 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC27A3Q5K4L6 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC27A3Q5K4L6 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC27A3Q5K4L6 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC27A3Q5K4L6 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC27A3Q5K4L6 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC27A3Q5K4L6 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC27A3Q5K4L6 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC27A3Q5K4L6 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC27A3Q5K4L6 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC27A3Q5K4L6 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC27A3Q5K4L6 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC27A3Q5K4L6 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC27A3Q5K4L6 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC27A3Q5K4L6 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC27A3Q5K4L6 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC27A3Q5K4L6 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC27A3Q5K4L6 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC27A3Q5K4L6 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC27A3Q5K4L6 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC27A3Q5K4L6 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC27A3Q5K4L6 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC27A3Q5K4L6 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC27A3Q5K4L6 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC27A3Q5K4L6 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC27A3Q5K4L6 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC27A3Q5K4L6 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC27A3Q5K4L6 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC27A3Q5K4L6 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC27A3Q5K4L6 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC27A3Q5K4L6 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC27A3Q5K4L6 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC27A3Q5K4L6 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC27A3Q5K4L6 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC27A3Q5K4L6 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC27A3Q5K4L6 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC27A3Q5K4L6 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC27A3Q5K4L6 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC27A3Q5K4L6 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC27A3Q5K4L6 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC27A3Q5K4L6 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC27A3Q5K4L6 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC27A3Q5K4L6 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC27A3Q5K4L6 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC27A3Q5K4L6 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC27A3Q5K4L6 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC27A3Q5K4L6 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC27A3Q5K4L6 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC27A3Q5K4L6 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC27A3Q5K4L6 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC27A3Q5K4L6 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC27A3Q5K4L6 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC27A3Q5K4L6 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC27A3Q5K4L6 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC27A3Q5K4L6 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC27A3Q5K4L6 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC27A3Q5K4L6 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC27A3Q5K4L6 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC27A3Q5K4L6 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC27A3Q5K4L6 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC27A3Q5K4L6 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC27A3Q5K4L6 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC27A3Q5K4L6 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC27A3Q5K4L6 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC27A3Q5K4L6 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC27A3Q5K4L6 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC27A3Q5K4L6 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC27A3Q5K4L6 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC27A3Q5K4L6 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC27A3Q5K4L6 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC27A3Q5K4L6 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC27A3Q5K4L6 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC27A3Q5K4L6 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC27A3Q5K4L6 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SLC27A3Q5K4L6 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
SLC27A3Q5K4L6 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms