Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUK3

KCNT1, Potassium channel subfamily T member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNT1Q5JUK3 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNT1Q5JUK3 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNT1Q5JUK3 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNT1Q5JUK3 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNT1Q5JUK3 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNT1Q5JUK3 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNT1Q5JUK3 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNT1Q5JUK3 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNT1Q5JUK3 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNT1Q5JUK3 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNT1Q5JUK3 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNT1Q5JUK3 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNT1Q5JUK3 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNT1Q5JUK3 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNT1Q5JUK3 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNT1Q5JUK3 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNT1Q5JUK3 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNT1Q5JUK3 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNT1Q5JUK3 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNT1Q5JUK3 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNT1Q5JUK3 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNT1Q5JUK3 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNT1Q5JUK3 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNT1Q5JUK3 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNT1Q5JUK3 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNT1Q5JUK3 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNT1Q5JUK3 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNT1Q5JUK3 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNT1Q5JUK3 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNT1Q5JUK3 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNT1Q5JUK3 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNT1Q5JUK3 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNT1Q5JUK3 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNT1Q5JUK3 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNT1Q5JUK3 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNT1Q5JUK3 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNT1Q5JUK3 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KCNT1Q5JUK3 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KCNT1Q5JUK3 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
KCNT1Q5JUK3 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KCNT1Q5JUK3 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
KCNT1Q5JUK3 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KCNT1Q5JUK3 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
KCNT1Q5JUK3 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
KCNT1Q5JUK3 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KCNT1Q5JUK3 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
KCNT1Q5JUK3 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KCNT1Q5JUK3 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KCNT1Q5JUK3 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KCNT1Q5JUK3 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KCNT1Q5JUK3 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KCNT1Q5JUK3 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KCNT1Q5JUK3 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KCNT1Q5JUK3 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KCNT1Q5JUK3 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
KCNT1Q5JUK3 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KCNT1Q5JUK3 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KCNT1Q5JUK3 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KCNT1Q5JUK3 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KCNT1Q5JUK3 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KCNT1Q5JUK3 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KCNT1Q5JUK3 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KCNT1Q5JUK3 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KCNT1Q5JUK3 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC17■□□□□ 0.31
KCNT1Q5JUK3 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KCNT1Q5JUK3 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KCNT1Q5JUK3 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KCNT1Q5JUK3 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
KCNT1Q5JUK3 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC17■□□□□ 0.31
KCNT1Q5JUK3 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC17■□□□□ 0.31
KCNT1Q5JUK3 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KCNT1Q5JUK3 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
KCNT1Q5JUK3 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
KCNT1Q5JUK3 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
KCNT1Q5JUK3 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC17■□□□□ 0.31
KCNT1Q5JUK3 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KCNT1Q5JUK3 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC17■□□□□ 0.31
KCNT1Q5JUK3 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
KCNT1Q5JUK3 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
KCNT1Q5JUK3 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
KCNT1Q5JUK3 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KCNT1Q5JUK3 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
KCNT1Q5JUK3 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
KCNT1Q5JUK3 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KCNT1Q5JUK3 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC17■□□□□ 0.31
KCNT1Q5JUK3 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KCNT1Q5JUK3 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KCNT1Q5JUK3 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
KCNT1Q5JUK3 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KCNT1Q5JUK3 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KCNT1Q5JUK3 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
KCNT1Q5JUK3 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KCNT1Q5JUK3 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KCNT1Q5JUK3 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KCNT1Q5JUK3 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KCNT1Q5JUK3 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KCNT1Q5JUK3 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KCNT1Q5JUK3 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNT1Q5JUK3 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNT1Q5JUK3 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms