Protein–RNA interactions for Protein: Q58WW2

DCAF6, DDB1- and CUL4-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF6Q58WW2 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DCAF6Q58WW2 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DCAF6Q58WW2 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DCAF6Q58WW2 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DCAF6Q58WW2 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DCAF6Q58WW2 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DCAF6Q58WW2 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DCAF6Q58WW2 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DCAF6Q58WW2 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DCAF6Q58WW2 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DCAF6Q58WW2 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DCAF6Q58WW2 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DCAF6Q58WW2 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DCAF6Q58WW2 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DCAF6Q58WW2 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DCAF6Q58WW2 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DCAF6Q58WW2 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DCAF6Q58WW2 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DCAF6Q58WW2 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DCAF6Q58WW2 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DCAF6Q58WW2 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DCAF6Q58WW2 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DCAF6Q58WW2 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DCAF6Q58WW2 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DCAF6Q58WW2 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DCAF6Q58WW2 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DCAF6Q58WW2 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DCAF6Q58WW2 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DCAF6Q58WW2 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DCAF6Q58WW2 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DCAF6Q58WW2 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DCAF6Q58WW2 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DCAF6Q58WW2 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
DCAF6Q58WW2 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DCAF6Q58WW2 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DCAF6Q58WW2 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DCAF6Q58WW2 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DCAF6Q58WW2 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DCAF6Q58WW2 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DCAF6Q58WW2 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DCAF6Q58WW2 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DCAF6Q58WW2 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DCAF6Q58WW2 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DCAF6Q58WW2 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DCAF6Q58WW2 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DCAF6Q58WW2 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DCAF6Q58WW2 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DCAF6Q58WW2 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DCAF6Q58WW2 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DCAF6Q58WW2 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DCAF6Q58WW2 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DCAF6Q58WW2 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DCAF6Q58WW2 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DCAF6Q58WW2 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DCAF6Q58WW2 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DCAF6Q58WW2 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DCAF6Q58WW2 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DCAF6Q58WW2 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
DCAF6Q58WW2 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DCAF6Q58WW2 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DCAF6Q58WW2 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DCAF6Q58WW2 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
DCAF6Q58WW2 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
DCAF6Q58WW2 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DCAF6Q58WW2 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DCAF6Q58WW2 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DCAF6Q58WW2 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DCAF6Q58WW2 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DCAF6Q58WW2 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DCAF6Q58WW2 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DCAF6Q58WW2 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
DCAF6Q58WW2 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DCAF6Q58WW2 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DCAF6Q58WW2 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DCAF6Q58WW2 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DCAF6Q58WW2 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DCAF6Q58WW2 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DCAF6Q58WW2 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DCAF6Q58WW2 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DCAF6Q58WW2 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DCAF6Q58WW2 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DCAF6Q58WW2 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DCAF6Q58WW2 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DCAF6Q58WW2 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DCAF6Q58WW2 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DCAF6Q58WW2 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DCAF6Q58WW2 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DCAF6Q58WW2 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DCAF6Q58WW2 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DCAF6Q58WW2 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DCAF6Q58WW2 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DCAF6Q58WW2 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
DCAF6Q58WW2 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DCAF6Q58WW2 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
DCAF6Q58WW2 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DCAF6Q58WW2 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
DCAF6Q58WW2 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DCAF6Q58WW2 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DCAF6Q58WW2 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DCAF6Q58WW2 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms