Protein–RNA interactions for Protein: Q53HC0

CCDC92, Coiled-coil domain-containing protein 92, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC92Q53HC0 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC92Q53HC0 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC92Q53HC0 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC92Q53HC0 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC92Q53HC0 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC92Q53HC0 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC92Q53HC0 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC92Q53HC0 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC92Q53HC0 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC92Q53HC0 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC92Q53HC0 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC92Q53HC0 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC92Q53HC0 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC92Q53HC0 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC92Q53HC0 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC92Q53HC0 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC92Q53HC0 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC92Q53HC0 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC92Q53HC0 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC92Q53HC0 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC92Q53HC0 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC92Q53HC0 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC92Q53HC0 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC92Q53HC0 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC92Q53HC0 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC92Q53HC0 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC92Q53HC0 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC92Q53HC0 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC92Q53HC0 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC92Q53HC0 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC92Q53HC0 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC92Q53HC0 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC92Q53HC0 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC92Q53HC0 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCDC92Q53HC0 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCDC92Q53HC0 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCDC92Q53HC0 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCDC92Q53HC0 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCDC92Q53HC0 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCDC92Q53HC0 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCDC92Q53HC0 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
CCDC92Q53HC0 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC92Q53HC0 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC92Q53HC0 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC92Q53HC0 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC92Q53HC0 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC92Q53HC0 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC92Q53HC0 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC92Q53HC0 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC92Q53HC0 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC92Q53HC0 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC92Q53HC0 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC92Q53HC0 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC92Q53HC0 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CCDC92Q53HC0 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CCDC92Q53HC0 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC92Q53HC0 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CCDC92Q53HC0 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CCDC92Q53HC0 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC92Q53HC0 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC92Q53HC0 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CCDC92Q53HC0 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC92Q53HC0 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC92Q53HC0 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC92Q53HC0 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC92Q53HC0 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC92Q53HC0 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC92Q53HC0 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CCDC92Q53HC0 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC92Q53HC0 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC92Q53HC0 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC92Q53HC0 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC92Q53HC0 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC92Q53HC0 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC92Q53HC0 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC92Q53HC0 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC92Q53HC0 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC92Q53HC0 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC92Q53HC0 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC92Q53HC0 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC92Q53HC0 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC92Q53HC0 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC92Q53HC0 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC92Q53HC0 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CCDC92Q53HC0 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC92Q53HC0 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC92Q53HC0 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC92Q53HC0 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC92Q53HC0 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC92Q53HC0 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC92Q53HC0 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC92Q53HC0 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC92Q53HC0 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC92Q53HC0 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC92Q53HC0 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC92Q53HC0 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC92Q53HC0 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC92Q53HC0 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC92Q53HC0 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC92Q53HC0 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms