Protein–RNA interactions for Protein: Q53EU6

GPAT3, Glycerol-3-phosphate acyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPAT3Q53EU6 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GPAT3Q53EU6 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GPAT3Q53EU6 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GPAT3Q53EU6 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GPAT3Q53EU6 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GPAT3Q53EU6 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GPAT3Q53EU6 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GPAT3Q53EU6 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GPAT3Q53EU6 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GPAT3Q53EU6 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GPAT3Q53EU6 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GPAT3Q53EU6 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GPAT3Q53EU6 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GPAT3Q53EU6 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GPAT3Q53EU6 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GPAT3Q53EU6 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GPAT3Q53EU6 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GPAT3Q53EU6 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GPAT3Q53EU6 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GPAT3Q53EU6 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GPAT3Q53EU6 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GPAT3Q53EU6 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GPAT3Q53EU6 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GPAT3Q53EU6 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GPAT3Q53EU6 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GPAT3Q53EU6 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GPAT3Q53EU6 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GPAT3Q53EU6 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GPAT3Q53EU6 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GPAT3Q53EU6 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GPAT3Q53EU6 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GPAT3Q53EU6 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GPAT3Q53EU6 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GPAT3Q53EU6 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GPAT3Q53EU6 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GPAT3Q53EU6 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GPAT3Q53EU6 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GPAT3Q53EU6 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GPAT3Q53EU6 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GPAT3Q53EU6 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GPAT3Q53EU6 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GPAT3Q53EU6 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GPAT3Q53EU6 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GPAT3Q53EU6 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GPAT3Q53EU6 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GPAT3Q53EU6 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GPAT3Q53EU6 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GPAT3Q53EU6 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GPAT3Q53EU6 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GPAT3Q53EU6 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GPAT3Q53EU6 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GPAT3Q53EU6 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GPAT3Q53EU6 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GPAT3Q53EU6 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GPAT3Q53EU6 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GPAT3Q53EU6 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GPAT3Q53EU6 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GPAT3Q53EU6 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GPAT3Q53EU6 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GPAT3Q53EU6 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GPAT3Q53EU6 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GPAT3Q53EU6 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GPAT3Q53EU6 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GPAT3Q53EU6 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GPAT3Q53EU6 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GPAT3Q53EU6 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GPAT3Q53EU6 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GPAT3Q53EU6 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GPAT3Q53EU6 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GPAT3Q53EU6 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GPAT3Q53EU6 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GPAT3Q53EU6 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GPAT3Q53EU6 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GPAT3Q53EU6 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GPAT3Q53EU6 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GPAT3Q53EU6 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GPAT3Q53EU6 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GPAT3Q53EU6 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GPAT3Q53EU6 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GPAT3Q53EU6 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GPAT3Q53EU6 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GPAT3Q53EU6 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GPAT3Q53EU6 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GPAT3Q53EU6 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GPAT3Q53EU6 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GPAT3Q53EU6 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GPAT3Q53EU6 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GPAT3Q53EU6 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GPAT3Q53EU6 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GPAT3Q53EU6 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GPAT3Q53EU6 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GPAT3Q53EU6 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GPAT3Q53EU6 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GPAT3Q53EU6 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GPAT3Q53EU6 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GPAT3Q53EU6 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GPAT3Q53EU6 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GPAT3Q53EU6 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GPAT3Q53EU6 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GPAT3Q53EU6 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms