Protein–RNA interactions for Protein: Q4AC94

C2CD3, C2 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 2,353 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2CD3Q4AC94 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
C2CD3Q4AC94 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
C2CD3Q4AC94 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
C2CD3Q4AC94 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
C2CD3Q4AC94 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
C2CD3Q4AC94 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
C2CD3Q4AC94 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
C2CD3Q4AC94 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
C2CD3Q4AC94 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
C2CD3Q4AC94 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
C2CD3Q4AC94 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
C2CD3Q4AC94 AC012379.2-201ENST00000560237 765 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
C2CD3Q4AC94 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
C2CD3Q4AC94 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
C2CD3Q4AC94 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
C2CD3Q4AC94 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
C2CD3Q4AC94 AL138720.1-201ENST00000629853 778 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
C2CD3Q4AC94 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
C2CD3Q4AC94 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
C2CD3Q4AC94 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
C2CD3Q4AC94 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
C2CD3Q4AC94 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C2CD3Q4AC94 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C2CD3Q4AC94 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C2CD3Q4AC94 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C2CD3Q4AC94 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C2CD3Q4AC94 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C2CD3Q4AC94 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C2CD3Q4AC94 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C2CD3Q4AC94 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C2CD3Q4AC94 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C2CD3Q4AC94 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C2CD3Q4AC94 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C2CD3Q4AC94 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C2CD3Q4AC94 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C2CD3Q4AC94 AL357373.1-201ENST00000394974 322 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
C2CD3Q4AC94 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C2CD3Q4AC94 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C2CD3Q4AC94 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C2CD3Q4AC94 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
C2CD3Q4AC94 AC245884.1-201ENST00000457113 529 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C2CD3Q4AC94 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C2CD3Q4AC94 AC027139.1-201ENST00000565286 951 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
C2CD3Q4AC94 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C2CD3Q4AC94 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C2CD3Q4AC94 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C2CD3Q4AC94 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C2CD3Q4AC94 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C2CD3Q4AC94 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C2CD3Q4AC94 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C2CD3Q4AC94 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C2CD3Q4AC94 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C2CD3Q4AC94 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C2CD3Q4AC94 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C2CD3Q4AC94 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C2CD3Q4AC94 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C2CD3Q4AC94 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C2CD3Q4AC94 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C2CD3Q4AC94 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C2CD3Q4AC94 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C2CD3Q4AC94 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C2CD3Q4AC94 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C2CD3Q4AC94 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C2CD3Q4AC94 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C2CD3Q4AC94 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
C2CD3Q4AC94 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C2CD3Q4AC94 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
C2CD3Q4AC94 AL353622.2-201ENST00000605846 425 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
C2CD3Q4AC94 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C2CD3Q4AC94 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C2CD3Q4AC94 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C2CD3Q4AC94 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C2CD3Q4AC94 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C2CD3Q4AC94 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C2CD3Q4AC94 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C2CD3Q4AC94 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C2CD3Q4AC94 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C2CD3Q4AC94 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C2CD3Q4AC94 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C2CD3Q4AC94 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C2CD3Q4AC94 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C2CD3Q4AC94 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C2CD3Q4AC94 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C2CD3Q4AC94 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C2CD3Q4AC94 SCAF11-203ENST00000395453 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
C2CD3Q4AC94 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C2CD3Q4AC94 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
C2CD3Q4AC94 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
C2CD3Q4AC94 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
C2CD3Q4AC94 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
C2CD3Q4AC94 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
C2CD3Q4AC94 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C2CD3Q4AC94 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
C2CD3Q4AC94 MRPL49-209ENST00000534078 518 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
C2CD3Q4AC94 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
C2CD3Q4AC94 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C2CD3Q4AC94 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
C2CD3Q4AC94 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
C2CD3Q4AC94 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
C2CD3Q4AC94 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms