Protein–RNA interactions for Protein: Q3B8N5

PROX2, Prospero homeobox protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROX2Q3B8N5 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PROX2Q3B8N5 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PROX2Q3B8N5 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PROX2Q3B8N5 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PROX2Q3B8N5 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PROX2Q3B8N5 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PROX2Q3B8N5 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PROX2Q3B8N5 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PROX2Q3B8N5 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PROX2Q3B8N5 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PROX2Q3B8N5 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PROX2Q3B8N5 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PROX2Q3B8N5 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PROX2Q3B8N5 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PROX2Q3B8N5 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PROX2Q3B8N5 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PROX2Q3B8N5 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PROX2Q3B8N5 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PROX2Q3B8N5 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PROX2Q3B8N5 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PROX2Q3B8N5 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PROX2Q3B8N5 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PROX2Q3B8N5 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PROX2Q3B8N5 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PROX2Q3B8N5 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PROX2Q3B8N5 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PROX2Q3B8N5 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PROX2Q3B8N5 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PROX2Q3B8N5 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PROX2Q3B8N5 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PROX2Q3B8N5 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PROX2Q3B8N5 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PROX2Q3B8N5 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PROX2Q3B8N5 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PROX2Q3B8N5 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PROX2Q3B8N5 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PROX2Q3B8N5 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PROX2Q3B8N5 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PROX2Q3B8N5 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PROX2Q3B8N5 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PROX2Q3B8N5 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PROX2Q3B8N5 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
PROX2Q3B8N5 ATXN3-201ENST00000340660 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PROX2Q3B8N5 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PROX2Q3B8N5 AC010422.1-201ENST00000414548 543 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PROX2Q3B8N5 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
PROX2Q3B8N5 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PROX2Q3B8N5 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PROX2Q3B8N5 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PROX2Q3B8N5 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PROX2Q3B8N5 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PROX2Q3B8N5 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PROX2Q3B8N5 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PROX2Q3B8N5 AL391262.2-201ENST00000622466 494 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PROX2Q3B8N5 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PROX2Q3B8N5 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PROX2Q3B8N5 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PROX2Q3B8N5 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PROX2Q3B8N5 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PROX2Q3B8N5 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PROX2Q3B8N5 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PROX2Q3B8N5 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PROX2Q3B8N5 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PROX2Q3B8N5 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PROX2Q3B8N5 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PROX2Q3B8N5 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PROX2Q3B8N5 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PROX2Q3B8N5 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PROX2Q3B8N5 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PROX2Q3B8N5 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PROX2Q3B8N5 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PROX2Q3B8N5 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PROX2Q3B8N5 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PROX2Q3B8N5 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PROX2Q3B8N5 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PROX2Q3B8N5 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PROX2Q3B8N5 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PROX2Q3B8N5 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PROX2Q3B8N5 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PROX2Q3B8N5 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PROX2Q3B8N5 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PROX2Q3B8N5 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PROX2Q3B8N5 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PROX2Q3B8N5 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PROX2Q3B8N5 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PROX2Q3B8N5 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PROX2Q3B8N5 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PROX2Q3B8N5 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PROX2Q3B8N5 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PROX2Q3B8N5 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PROX2Q3B8N5 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PROX2Q3B8N5 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PROX2Q3B8N5 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PROX2Q3B8N5 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PROX2Q3B8N5 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PROX2Q3B8N5 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PROX2Q3B8N5 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PROX2Q3B8N5 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PROX2Q3B8N5 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PROX2Q3B8N5 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms