Protein–RNA interactions for Protein: Q32P28

P3H1, Prolyl 3-hydroxylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P3H1Q32P28 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P3H1Q32P28 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P3H1Q32P28 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
P3H1Q32P28 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P3H1Q32P28 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
P3H1Q32P28 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P3H1Q32P28 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
P3H1Q32P28 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P3H1Q32P28 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
P3H1Q32P28 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P3H1Q32P28 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
P3H1Q32P28 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
P3H1Q32P28 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P3H1Q32P28 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
P3H1Q32P28 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P3H1Q32P28 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P3H1Q32P28 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P3H1Q32P28 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
P3H1Q32P28 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P3H1Q32P28 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P3H1Q32P28 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P3H1Q32P28 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P3H1Q32P28 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P3H1Q32P28 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
P3H1Q32P28 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P3H1Q32P28 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
P3H1Q32P28 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
P3H1Q32P28 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P3H1Q32P28 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
P3H1Q32P28 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
P3H1Q32P28 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
P3H1Q32P28 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
P3H1Q32P28 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
P3H1Q32P28 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
P3H1Q32P28 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
P3H1Q32P28 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P3H1Q32P28 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
P3H1Q32P28 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P3H1Q32P28 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P3H1Q32P28 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P3H1Q32P28 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
P3H1Q32P28 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
P3H1Q32P28 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
P3H1Q32P28 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P3H1Q32P28 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P3H1Q32P28 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
P3H1Q32P28 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P3H1Q32P28 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
P3H1Q32P28 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P3H1Q32P28 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P3H1Q32P28 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P3H1Q32P28 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
P3H1Q32P28 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
P3H1Q32P28 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
P3H1Q32P28 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
P3H1Q32P28 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
P3H1Q32P28 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
P3H1Q32P28 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
P3H1Q32P28 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
P3H1Q32P28 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
P3H1Q32P28 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
P3H1Q32P28 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
P3H1Q32P28 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
P3H1Q32P28 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
P3H1Q32P28 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
P3H1Q32P28 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
P3H1Q32P28 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
P3H1Q32P28 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
P3H1Q32P28 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
P3H1Q32P28 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
P3H1Q32P28 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
P3H1Q32P28 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
P3H1Q32P28 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
P3H1Q32P28 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
P3H1Q32P28 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
P3H1Q32P28 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
P3H1Q32P28 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
P3H1Q32P28 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
P3H1Q32P28 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
P3H1Q32P28 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
P3H1Q32P28 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
P3H1Q32P28 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
P3H1Q32P28 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
P3H1Q32P28 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
P3H1Q32P28 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
P3H1Q32P28 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
P3H1Q32P28 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
P3H1Q32P28 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
P3H1Q32P28 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
P3H1Q32P28 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
P3H1Q32P28 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
P3H1Q32P28 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
P3H1Q32P28 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
P3H1Q32P28 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
P3H1Q32P28 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
P3H1Q32P28 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
P3H1Q32P28 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
P3H1Q32P28 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
P3H1Q32P28 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
P3H1Q32P28 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms