Protein–RNA interactions for Protein: Q309B1

TRIM16L, Tripartite motif-containing protein 16-like protein, humanhuman

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM16LQ309B1 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TRIM16LQ309B1 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TRIM16LQ309B1 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TRIM16LQ309B1 DOCK4-206ENST00000437633 6212 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TRIM16LQ309B1 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TRIM16LQ309B1 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TRIM16LQ309B1 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TRIM16LQ309B1 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TRIM16LQ309B1 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TRIM16LQ309B1 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TRIM16LQ309B1 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TRIM16LQ309B1 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TRIM16LQ309B1 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TRIM16LQ309B1 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TRIM16LQ309B1 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TRIM16LQ309B1 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TRIM16LQ309B1 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TRIM16LQ309B1 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TRIM16LQ309B1 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TRIM16LQ309B1 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TRIM16LQ309B1 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TRIM16LQ309B1 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TRIM16LQ309B1 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TRIM16LQ309B1 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TRIM16LQ309B1 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TRIM16LQ309B1 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TRIM16LQ309B1 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TRIM16LQ309B1 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TRIM16LQ309B1 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TRIM16LQ309B1 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TRIM16LQ309B1 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
TRIM16LQ309B1 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TRIM16LQ309B1 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TRIM16LQ309B1 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TRIM16LQ309B1 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
TRIM16LQ309B1 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TRIM16LQ309B1 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TRIM16LQ309B1 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TRIM16LQ309B1 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TRIM16LQ309B1 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TRIM16LQ309B1 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TRIM16LQ309B1 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TRIM16LQ309B1 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
TRIM16LQ309B1 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TRIM16LQ309B1 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TRIM16LQ309B1 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TRIM16LQ309B1 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TRIM16LQ309B1 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TRIM16LQ309B1 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TRIM16LQ309B1 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TRIM16LQ309B1 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TRIM16LQ309B1 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TRIM16LQ309B1 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TRIM16LQ309B1 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TRIM16LQ309B1 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TRIM16LQ309B1 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TRIM16LQ309B1 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TRIM16LQ309B1 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TRIM16LQ309B1 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
TRIM16LQ309B1 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRIM16LQ309B1 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRIM16LQ309B1 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRIM16LQ309B1 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRIM16LQ309B1 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRIM16LQ309B1 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRIM16LQ309B1 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRIM16LQ309B1 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRIM16LQ309B1 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRIM16LQ309B1 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRIM16LQ309B1 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRIM16LQ309B1 CFAP74-209ENST00000493964 5247 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRIM16LQ309B1 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRIM16LQ309B1 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRIM16LQ309B1 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRIM16LQ309B1 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRIM16LQ309B1 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRIM16LQ309B1 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRIM16LQ309B1 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
TRIM16LQ309B1 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRIM16LQ309B1 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRIM16LQ309B1 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRIM16LQ309B1 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRIM16LQ309B1 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
TRIM16LQ309B1 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRIM16LQ309B1 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRIM16LQ309B1 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRIM16LQ309B1 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
TRIM16LQ309B1 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRIM16LQ309B1 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRIM16LQ309B1 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRIM16LQ309B1 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRIM16LQ309B1 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRIM16LQ309B1 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRIM16LQ309B1 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRIM16LQ309B1 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRIM16LQ309B1 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRIM16LQ309B1 YIPF6-204ENST00000462683 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRIM16LQ309B1 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRIM16LQ309B1 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRIM16LQ309B1 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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