Protein–RNA interactions for Protein: Q2YD98

UVSSA, UV-stimulated scaffold protein A, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UVSSAQ2YD98 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
UVSSAQ2YD98 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
UVSSAQ2YD98 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
UVSSAQ2YD98 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
UVSSAQ2YD98 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
UVSSAQ2YD98 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
UVSSAQ2YD98 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
UVSSAQ2YD98 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
UVSSAQ2YD98 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
UVSSAQ2YD98 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
UVSSAQ2YD98 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
UVSSAQ2YD98 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
UVSSAQ2YD98 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
UVSSAQ2YD98 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
UVSSAQ2YD98 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
UVSSAQ2YD98 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
UVSSAQ2YD98 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
UVSSAQ2YD98 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
UVSSAQ2YD98 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
UVSSAQ2YD98 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
UVSSAQ2YD98 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
UVSSAQ2YD98 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
UVSSAQ2YD98 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
UVSSAQ2YD98 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
UVSSAQ2YD98 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
UVSSAQ2YD98 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
UVSSAQ2YD98 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UVSSAQ2YD98 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UVSSAQ2YD98 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UVSSAQ2YD98 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UVSSAQ2YD98 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UVSSAQ2YD98 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UVSSAQ2YD98 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UVSSAQ2YD98 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
UVSSAQ2YD98 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UVSSAQ2YD98 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UVSSAQ2YD98 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
UVSSAQ2YD98 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
UVSSAQ2YD98 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
UVSSAQ2YD98 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
UVSSAQ2YD98 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
UVSSAQ2YD98 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
UVSSAQ2YD98 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
UVSSAQ2YD98 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
UVSSAQ2YD98 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
UVSSAQ2YD98 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
UVSSAQ2YD98 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UVSSAQ2YD98 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
UVSSAQ2YD98 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
UVSSAQ2YD98 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
UVSSAQ2YD98 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UVSSAQ2YD98 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UVSSAQ2YD98 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UVSSAQ2YD98 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UVSSAQ2YD98 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UVSSAQ2YD98 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UVSSAQ2YD98 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UVSSAQ2YD98 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
UVSSAQ2YD98 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UVSSAQ2YD98 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UVSSAQ2YD98 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
UVSSAQ2YD98 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UVSSAQ2YD98 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
UVSSAQ2YD98 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UVSSAQ2YD98 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UVSSAQ2YD98 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UVSSAQ2YD98 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
UVSSAQ2YD98 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UVSSAQ2YD98 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
UVSSAQ2YD98 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UVSSAQ2YD98 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
UVSSAQ2YD98 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
UVSSAQ2YD98 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UVSSAQ2YD98 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UVSSAQ2YD98 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
UVSSAQ2YD98 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UVSSAQ2YD98 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
UVSSAQ2YD98 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
UVSSAQ2YD98 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
UVSSAQ2YD98 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UVSSAQ2YD98 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
UVSSAQ2YD98 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
UVSSAQ2YD98 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
UVSSAQ2YD98 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
UVSSAQ2YD98 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
UVSSAQ2YD98 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
UVSSAQ2YD98 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
UVSSAQ2YD98 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
UVSSAQ2YD98 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
UVSSAQ2YD98 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
UVSSAQ2YD98 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
UVSSAQ2YD98 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
UVSSAQ2YD98 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UVSSAQ2YD98 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
UVSSAQ2YD98 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UVSSAQ2YD98 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UVSSAQ2YD98 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UVSSAQ2YD98 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UVSSAQ2YD98 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UVSSAQ2YD98 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms