Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
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