Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
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