Protein–RNA interactions for Protein: Q16864

ATP6V1F, V-type proton ATPase subunit F, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1FQ16864 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC13□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC13□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
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