Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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PTPRNQ16849 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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PTPRNQ16849 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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PTPRNQ16849 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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PTPRNQ16849 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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PTPRNQ16849 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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PTPRNQ16849 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
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PTPRNQ16849 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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PTPRNQ16849 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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PTPRNQ16849 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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PTPRNQ16849 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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