Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RTN1Q16799 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
RTN1Q16799 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
RTN1Q16799 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RTN1Q16799 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RTN1Q16799 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RTN1Q16799 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RTN1Q16799 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RTN1Q16799 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RTN1Q16799 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RTN1Q16799 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RTN1Q16799 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RTN1Q16799 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RTN1Q16799 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RTN1Q16799 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RTN1Q16799 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RTN1Q16799 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RTN1Q16799 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RTN1Q16799 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RTN1Q16799 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RTN1Q16799 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RTN1Q16799 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RTN1Q16799 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RTN1Q16799 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RTN1Q16799 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RTN1Q16799 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RTN1Q16799 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RTN1Q16799 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
RTN1Q16799 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
RTN1Q16799 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RTN1Q16799 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RTN1Q16799 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RTN1Q16799 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RTN1Q16799 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RTN1Q16799 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RTN1Q16799 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RTN1Q16799 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RTN1Q16799 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RTN1Q16799 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RTN1Q16799 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
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RTN1Q16799 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
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RTN1Q16799 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
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RTN1Q16799 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RTN1Q16799 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RTN1Q16799 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RTN1Q16799 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RTN1Q16799 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RTN1Q16799 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RTN1Q16799 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RTN1Q16799 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RTN1Q16799 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RTN1Q16799 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RTN1Q16799 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RTN1Q16799 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RTN1Q16799 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RTN1Q16799 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RTN1Q16799 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RTN1Q16799 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
RTN1Q16799 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RTN1Q16799 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
RTN1Q16799 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RTN1Q16799 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RTN1Q16799 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
RTN1Q16799 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RTN1Q16799 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
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