Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SGCAQ16586 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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SGCAQ16586 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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SGCAQ16586 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
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SGCAQ16586 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SGCAQ16586 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SGCAQ16586 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SGCAQ16586 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
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SGCAQ16586 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
SGCAQ16586 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SGCAQ16586 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
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SGCAQ16586 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SGCAQ16586 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SGCAQ16586 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
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