Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SSX1Q16384 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SSX1Q16384 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SSX1Q16384 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SSX1Q16384 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SSX1Q16384 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SSX1Q16384 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SSX1Q16384 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SSX1Q16384 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SSX1Q16384 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SSX1Q16384 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SSX1Q16384 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SSX1Q16384 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SSX1Q16384 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SSX1Q16384 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SSX1Q16384 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SSX1Q16384 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SSX1Q16384 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SSX1Q16384 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
SSX1Q16384 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SSX1Q16384 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
SSX1Q16384 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SSX1Q16384 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
SSX1Q16384 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SSX1Q16384 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SSX1Q16384 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
SSX1Q16384 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SSX1Q16384 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
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SSX1Q16384 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
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SSX1Q16384 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
SSX1Q16384 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SSX1Q16384 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SSX1Q16384 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SSX1Q16384 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SSX1Q16384 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
SSX1Q16384 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SSX1Q16384 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
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SSX1Q16384 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
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SSX1Q16384 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SSX1Q16384 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
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SSX1Q16384 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
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SSX1Q16384 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
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SSX1Q16384 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SSX1Q16384 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
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SSX1Q16384 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
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SSX1Q16384 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SSX1Q16384 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SSX1Q16384 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SSX1Q16384 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SSX1Q16384 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SSX1Q16384 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SSX1Q16384 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SSX1Q16384 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SSX1Q16384 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SSX1Q16384 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SSX1Q16384 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SSX1Q16384 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SSX1Q16384 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SSX1Q16384 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SSX1Q16384 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SSX1Q16384 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SSX1Q16384 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
SSX1Q16384 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SSX1Q16384 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SSX1Q16384 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SSX1Q16384 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
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