Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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