Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms