Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NCOA1Q15788 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NCOA1Q15788 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NCOA1Q15788 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
NCOA1Q15788 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
NCOA1Q15788 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
NCOA1Q15788 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
NCOA1Q15788 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
NCOA1Q15788 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
NCOA1Q15788 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
NCOA1Q15788 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
NCOA1Q15788 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
NCOA1Q15788 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
NCOA1Q15788 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
NCOA1Q15788 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
NCOA1Q15788 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
NCOA1Q15788 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
NCOA1Q15788 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
NCOA1Q15788 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NCOA1Q15788 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NCOA1Q15788 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NCOA1Q15788 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NCOA1Q15788 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NCOA1Q15788 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NCOA1Q15788 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
NCOA1Q15788 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NCOA1Q15788 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NCOA1Q15788 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NCOA1Q15788 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NCOA1Q15788 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NCOA1Q15788 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
NCOA1Q15788 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NCOA1Q15788 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
NCOA1Q15788 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NCOA1Q15788 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
NCOA1Q15788 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
NCOA1Q15788 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NCOA1Q15788 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NCOA1Q15788 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NCOA1Q15788 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NCOA1Q15788 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NCOA1Q15788 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NCOA1Q15788 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
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NCOA1Q15788 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NCOA1Q15788 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NCOA1Q15788 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
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NCOA1Q15788 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NCOA1Q15788 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
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NCOA1Q15788 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NCOA1Q15788 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
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NCOA1Q15788 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NCOA1Q15788 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
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NCOA1Q15788 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
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NCOA1Q15788 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
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NCOA1Q15788 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NCOA1Q15788 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NCOA1Q15788 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NCOA1Q15788 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NCOA1Q15788 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NCOA1Q15788 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
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NCOA1Q15788 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NCOA1Q15788 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NCOA1Q15788 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NCOA1Q15788 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NCOA1Q15788 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NCOA1Q15788 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NCOA1Q15788 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NCOA1Q15788 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NCOA1Q15788 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NCOA1Q15788 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NCOA1Q15788 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
NCOA1Q15788 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NCOA1Q15788 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
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