Protein–RNA interactions for Protein: Q15645

TRIP13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP13Q15645 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIP13Q15645 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIP13Q15645 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIP13Q15645 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIP13Q15645 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIP13Q15645 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIP13Q15645 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIP13Q15645 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIP13Q15645 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIP13Q15645 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIP13Q15645 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIP13Q15645 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIP13Q15645 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIP13Q15645 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIP13Q15645 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIP13Q15645 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIP13Q15645 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIP13Q15645 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIP13Q15645 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIP13Q15645 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIP13Q15645 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIP13Q15645 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIP13Q15645 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIP13Q15645 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIP13Q15645 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIP13Q15645 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIP13Q15645 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIP13Q15645 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIP13Q15645 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIP13Q15645 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIP13Q15645 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIP13Q15645 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIP13Q15645 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIP13Q15645 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIP13Q15645 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIP13Q15645 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIP13Q15645 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIP13Q15645 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIP13Q15645 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIP13Q15645 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIP13Q15645 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIP13Q15645 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIP13Q15645 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIP13Q15645 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIP13Q15645 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIP13Q15645 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIP13Q15645 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIP13Q15645 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIP13Q15645 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIP13Q15645 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIP13Q15645 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIP13Q15645 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIP13Q15645 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIP13Q15645 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIP13Q15645 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIP13Q15645 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIP13Q15645 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIP13Q15645 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIP13Q15645 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIP13Q15645 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIP13Q15645 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIP13Q15645 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIP13Q15645 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIP13Q15645 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIP13Q15645 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIP13Q15645 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIP13Q15645 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIP13Q15645 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIP13Q15645 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIP13Q15645 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIP13Q15645 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIP13Q15645 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIP13Q15645 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIP13Q15645 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIP13Q15645 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIP13Q15645 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIP13Q15645 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIP13Q15645 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIP13Q15645 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIP13Q15645 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIP13Q15645 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIP13Q15645 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIP13Q15645 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIP13Q15645 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIP13Q15645 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIP13Q15645 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIP13Q15645 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIP13Q15645 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIP13Q15645 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIP13Q15645 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIP13Q15645 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIP13Q15645 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIP13Q15645 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIP13Q15645 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIP13Q15645 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIP13Q15645 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIP13Q15645 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIP13Q15645 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIP13Q15645 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIP13Q15645 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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