Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRF4Q15306 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRF4Q15306 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRF4Q15306 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRF4Q15306 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRF4Q15306 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRF4Q15306 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRF4Q15306 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRF4Q15306 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRF4Q15306 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRF4Q15306 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRF4Q15306 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRF4Q15306 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
IRF4Q15306 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRF4Q15306 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRF4Q15306 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRF4Q15306 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRF4Q15306 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
IRF4Q15306 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRF4Q15306 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRF4Q15306 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRF4Q15306 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRF4Q15306 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRF4Q15306 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRF4Q15306 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRF4Q15306 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRF4Q15306 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRF4Q15306 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRF4Q15306 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRF4Q15306 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRF4Q15306 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRF4Q15306 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRF4Q15306 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRF4Q15306 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRF4Q15306 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRF4Q15306 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRF4Q15306 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRF4Q15306 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRF4Q15306 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRF4Q15306 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRF4Q15306 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRF4Q15306 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRF4Q15306 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRF4Q15306 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
IRF4Q15306 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRF4Q15306 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRF4Q15306 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
IRF4Q15306 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRF4Q15306 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRF4Q15306 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRF4Q15306 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRF4Q15306 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
IRF4Q15306 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRF4Q15306 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRF4Q15306 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRF4Q15306 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
IRF4Q15306 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRF4Q15306 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRF4Q15306 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRF4Q15306 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRF4Q15306 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
IRF4Q15306 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRF4Q15306 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRF4Q15306 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRF4Q15306 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRF4Q15306 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRF4Q15306 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
IRF4Q15306 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRF4Q15306 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRF4Q15306 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRF4Q15306 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRF4Q15306 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRF4Q15306 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IRF4Q15306 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IRF4Q15306 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IRF4Q15306 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IRF4Q15306 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IRF4Q15306 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IRF4Q15306 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IRF4Q15306 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IRF4Q15306 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IRF4Q15306 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IRF4Q15306 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IRF4Q15306 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IRF4Q15306 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IRF4Q15306 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IRF4Q15306 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IRF4Q15306 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IRF4Q15306 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
IRF4Q15306 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IRF4Q15306 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
IRF4Q15306 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IRF4Q15306 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IRF4Q15306 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IRF4Q15306 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IRF4Q15306 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IRF4Q15306 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
IRF4Q15306 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IRF4Q15306 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IRF4Q15306 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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