Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PTPRKQ15262 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PTPRKQ15262 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PTPRKQ15262 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTPRKQ15262 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PTPRKQ15262 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTPRKQ15262 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTPRKQ15262 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTPRKQ15262 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PTPRKQ15262 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTPRKQ15262 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PTPRKQ15262 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PTPRKQ15262 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
PTPRKQ15262 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTPRKQ15262 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PTPRKQ15262 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
PTPRKQ15262 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTPRKQ15262 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTPRKQ15262 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PTPRKQ15262 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
PTPRKQ15262 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PTPRKQ15262 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PTPRKQ15262 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRKQ15262 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRKQ15262 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRKQ15262 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRKQ15262 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRKQ15262 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRKQ15262 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRKQ15262 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRKQ15262 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRKQ15262 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRKQ15262 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRKQ15262 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRKQ15262 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRKQ15262 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRKQ15262 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRKQ15262 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRKQ15262 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRKQ15262 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRKQ15262 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRKQ15262 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRKQ15262 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRKQ15262 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRKQ15262 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRKQ15262 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRKQ15262 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRKQ15262 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRKQ15262 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRKQ15262 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRKQ15262 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRKQ15262 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRKQ15262 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRKQ15262 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRKQ15262 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRKQ15262 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRKQ15262 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRKQ15262 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRKQ15262 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRKQ15262 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRKQ15262 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRKQ15262 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRKQ15262 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRKQ15262 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRKQ15262 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRKQ15262 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRKQ15262 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRKQ15262 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRKQ15262 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRKQ15262 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRKQ15262 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRKQ15262 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRKQ15262 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRKQ15262 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRKQ15262 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRKQ15262 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRKQ15262 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRKQ15262 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRKQ15262 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRKQ15262 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRKQ15262 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRKQ15262 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRKQ15262 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRKQ15262 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRKQ15262 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRKQ15262 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRKQ15262 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRKQ15262 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRKQ15262 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRKQ15262 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRKQ15262 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRKQ15262 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRKQ15262 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRKQ15262 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRKQ15262 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRKQ15262 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRKQ15262 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRKQ15262 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRKQ15262 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRKQ15262 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
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