Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PCOLCEQ15113 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PCOLCEQ15113 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PCOLCEQ15113 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PCOLCEQ15113 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PCOLCEQ15113 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PCOLCEQ15113 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PCOLCEQ15113 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PCOLCEQ15113 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PCOLCEQ15113 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PCOLCEQ15113 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
PCOLCEQ15113 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PCOLCEQ15113 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PCOLCEQ15113 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PCOLCEQ15113 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PCOLCEQ15113 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PCOLCEQ15113 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PCOLCEQ15113 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PCOLCEQ15113 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PCOLCEQ15113 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PCOLCEQ15113 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PCOLCEQ15113 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.8 ms