Protein–RNA interactions for Protein: Q15080

NCF4, Neutrophil cytosol factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF4Q15080 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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NCF4Q15080 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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NCF4Q15080 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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NCF4Q15080 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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NCF4Q15080 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
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NCF4Q15080 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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NCF4Q15080 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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NCF4Q15080 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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