Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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TRAM2Q15035 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
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TRAM2Q15035 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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TRAM2Q15035 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
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TRAM2Q15035 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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TRAM2Q15035 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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TRAM2Q15035 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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TRAM2Q15035 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
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