Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

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Length 1,142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COL19A1Q14993 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COL19A1Q14993 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COL19A1Q14993 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COL19A1Q14993 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COL19A1Q14993 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COL19A1Q14993 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COL19A1Q14993 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COL19A1Q14993 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COL19A1Q14993 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COL19A1Q14993 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COL19A1Q14993 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COL19A1Q14993 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COL19A1Q14993 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
COL19A1Q14993 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COL19A1Q14993 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
COL19A1Q14993 ATP5L2-201ENST00000505920 799 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COL19A1Q14993 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COL19A1Q14993 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COL19A1Q14993 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COL19A1Q14993 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COL19A1Q14993 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
COL19A1Q14993 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COL19A1Q14993 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
COL19A1Q14993 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COL19A1Q14993 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COL19A1Q14993 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COL19A1Q14993 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COL19A1Q14993 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COL19A1Q14993 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COL19A1Q14993 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COL19A1Q14993 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COL19A1Q14993 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COL19A1Q14993 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COL19A1Q14993 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COL19A1Q14993 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COL19A1Q14993 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COL19A1Q14993 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
COL19A1Q14993 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COL19A1Q14993 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
COL19A1Q14993 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
COL19A1Q14993 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
COL19A1Q14993 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
COL19A1Q14993 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
COL19A1Q14993 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
COL19A1Q14993 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
COL19A1Q14993 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
COL19A1Q14993 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
COL19A1Q14993 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
COL19A1Q14993 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
COL19A1Q14993 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
COL19A1Q14993 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
COL19A1Q14993 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
COL19A1Q14993 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
COL19A1Q14993 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
COL19A1Q14993 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
COL19A1Q14993 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
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COL19A1Q14993 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
COL19A1Q14993 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
COL19A1Q14993 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
COL19A1Q14993 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
COL19A1Q14993 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
COL19A1Q14993 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
COL19A1Q14993 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
COL19A1Q14993 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
COL19A1Q14993 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COL19A1Q14993 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COL19A1Q14993 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COL19A1Q14993 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COL19A1Q14993 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COL19A1Q14993 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
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COL19A1Q14993 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COL19A1Q14993 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COL19A1Q14993 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COL19A1Q14993 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COL19A1Q14993 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COL19A1Q14993 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COL19A1Q14993 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COL19A1Q14993 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COL19A1Q14993 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COL19A1Q14993 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COL19A1Q14993 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
COL19A1Q14993 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COL19A1Q14993 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COL19A1Q14993 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COL19A1Q14993 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COL19A1Q14993 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COL19A1Q14993 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COL19A1Q14993 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
COL19A1Q14993 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COL19A1Q14993 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
COL19A1Q14993 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
COL19A1Q14993 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COL19A1Q14993 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COL19A1Q14993 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COL19A1Q14993 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
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