Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NFIXQ14938 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NFIXQ14938 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NFIXQ14938 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NFIXQ14938 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NFIXQ14938 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NFIXQ14938 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NFIXQ14938 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NFIXQ14938 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NFIXQ14938 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NFIXQ14938 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NFIXQ14938 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NFIXQ14938 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NFIXQ14938 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NFIXQ14938 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NFIXQ14938 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NFIXQ14938 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NFIXQ14938 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NFIXQ14938 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NFIXQ14938 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NFIXQ14938 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NFIXQ14938 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NFIXQ14938 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NFIXQ14938 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NFIXQ14938 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NFIXQ14938 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NFIXQ14938 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NFIXQ14938 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NFIXQ14938 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NFIXQ14938 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NFIXQ14938 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NFIXQ14938 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NFIXQ14938 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NFIXQ14938 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NFIXQ14938 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NFIXQ14938 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NFIXQ14938 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NFIXQ14938 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NFIXQ14938 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NFIXQ14938 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NFIXQ14938 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NFIXQ14938 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NFIXQ14938 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NFIXQ14938 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NFIXQ14938 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NFIXQ14938 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NFIXQ14938 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
NFIXQ14938 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NFIXQ14938 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
NFIXQ14938 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NFIXQ14938 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
NFIXQ14938 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NFIXQ14938 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NFIXQ14938 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NFIXQ14938 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NFIXQ14938 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NFIXQ14938 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NFIXQ14938 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NFIXQ14938 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
NFIXQ14938 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NFIXQ14938 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NFIXQ14938 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NFIXQ14938 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NFIXQ14938 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NFIXQ14938 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NFIXQ14938 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NFIXQ14938 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NFIXQ14938 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NFIXQ14938 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NFIXQ14938 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NFIXQ14938 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NFIXQ14938 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NFIXQ14938 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NFIXQ14938 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
NFIXQ14938 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NFIXQ14938 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NFIXQ14938 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
NFIXQ14938 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
NFIXQ14938 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
NFIXQ14938 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
NFIXQ14938 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NFIXQ14938 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NFIXQ14938 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
NFIXQ14938 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NFIXQ14938 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NFIXQ14938 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NFIXQ14938 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NFIXQ14938 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NFIXQ14938 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NFIXQ14938 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NFIXQ14938 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NFIXQ14938 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NFIXQ14938 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NFIXQ14938 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NFIXQ14938 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NFIXQ14938 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NFIXQ14938 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NFIXQ14938 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NFIXQ14938 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NFIXQ14938 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
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