Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 TRIO-202ENST00000344204 11100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 NCOR2-208ENST00000429285 8475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 GRM1-204ENST00000492807 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 KLHL9-201ENST00000359039 5710 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 MIR193BHG-211ENST00000641433 5365 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 MYO16-202ENST00000356711 6874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
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SMCO1Q147U7 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 SMARCA5-201ENST00000283131 7923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 CACNA2D1-202ENST00000356860 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 RAP2B-201ENST00000323534 8351 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
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