Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

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Length 771 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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