Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDK13Q14004 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDK13Q14004 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDK13Q14004 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDK13Q14004 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDK13Q14004 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDK13Q14004 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDK13Q14004 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDK13Q14004 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDK13Q14004 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDK13Q14004 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDK13Q14004 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDK13Q14004 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDK13Q14004 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDK13Q14004 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDK13Q14004 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDK13Q14004 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDK13Q14004 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CDK13Q14004 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDK13Q14004 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDK13Q14004 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDK13Q14004 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDK13Q14004 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDK13Q14004 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDK13Q14004 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CDK13Q14004 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDK13Q14004 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CDK13Q14004 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDK13Q14004 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDK13Q14004 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDK13Q14004 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDK13Q14004 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDK13Q14004 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CDK13Q14004 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CDK13Q14004 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CDK13Q14004 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CDK13Q14004 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CDK13Q14004 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CDK13Q14004 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CDK13Q14004 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDK13Q14004 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDK13Q14004 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDK13Q14004 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDK13Q14004 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDK13Q14004 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDK13Q14004 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDK13Q14004 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDK13Q14004 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDK13Q14004 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDK13Q14004 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDK13Q14004 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDK13Q14004 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDK13Q14004 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDK13Q14004 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDK13Q14004 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDK13Q14004 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDK13Q14004 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDK13Q14004 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDK13Q14004 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDK13Q14004 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDK13Q14004 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CDK13Q14004 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDK13Q14004 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDK13Q14004 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDK13Q14004 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDK13Q14004 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDK13Q14004 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDK13Q14004 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDK13Q14004 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDK13Q14004 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDK13Q14004 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDK13Q14004 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDK13Q14004 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDK13Q14004 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDK13Q14004 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDK13Q14004 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CDK13Q14004 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDK13Q14004 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDK13Q14004 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDK13Q14004 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDK13Q14004 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDK13Q14004 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDK13Q14004 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDK13Q14004 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDK13Q14004 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDK13Q14004 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CDK13Q14004 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDK13Q14004 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDK13Q14004 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDK13Q14004 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDK13Q14004 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDK13Q14004 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDK13Q14004 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDK13Q14004 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDK13Q14004 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDK13Q14004 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDK13Q14004 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CDK13Q14004 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDK13Q14004 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDK13Q14004 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
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