Protein–RNA interactions for Protein: Q13938

CAPS, Calcyphosin, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPSQ13938 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CAPSQ13938 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CAPSQ13938 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CAPSQ13938 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CAPSQ13938 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CAPSQ13938 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CAPSQ13938 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CAPSQ13938 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CAPSQ13938 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CAPSQ13938 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CAPSQ13938 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CAPSQ13938 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CAPSQ13938 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CAPSQ13938 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CAPSQ13938 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CAPSQ13938 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CAPSQ13938 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CAPSQ13938 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CAPSQ13938 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CAPSQ13938 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CAPSQ13938 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CAPSQ13938 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CAPSQ13938 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CAPSQ13938 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CAPSQ13938 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CAPSQ13938 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CAPSQ13938 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CAPSQ13938 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CAPSQ13938 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CAPSQ13938 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CAPSQ13938 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CAPSQ13938 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CAPSQ13938 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CAPSQ13938 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CAPSQ13938 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CAPSQ13938 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CAPSQ13938 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CAPSQ13938 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CAPSQ13938 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CAPSQ13938 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CAPSQ13938 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CAPSQ13938 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CAPSQ13938 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CAPSQ13938 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CAPSQ13938 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CAPSQ13938 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CAPSQ13938 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CAPSQ13938 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CAPSQ13938 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CAPSQ13938 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CAPSQ13938 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CAPSQ13938 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CAPSQ13938 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CAPSQ13938 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CAPSQ13938 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CAPSQ13938 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CAPSQ13938 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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CAPSQ13938 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CAPSQ13938 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
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CAPSQ13938 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CAPSQ13938 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CAPSQ13938 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CAPSQ13938 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CAPSQ13938 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CAPSQ13938 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CAPSQ13938 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CAPSQ13938 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CAPSQ13938 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CAPSQ13938 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
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CAPSQ13938 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CAPSQ13938 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CAPSQ13938 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CAPSQ13938 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CAPSQ13938 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CAPSQ13938 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CAPSQ13938 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CAPSQ13938 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CAPSQ13938 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CAPSQ13938 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CAPSQ13938 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CAPSQ13938 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CAPSQ13938 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CAPSQ13938 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CAPSQ13938 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CAPSQ13938 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CAPSQ13938 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CAPSQ13938 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CAPSQ13938 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CAPSQ13938 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CAPSQ13938 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CAPSQ13938 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CAPSQ13938 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CAPSQ13938 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CAPSQ13938 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CAPSQ13938 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CAPSQ13938 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
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