Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

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Length 308 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
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