Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

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Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SHROOM2Q13796 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SHROOM2Q13796 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SHROOM2Q13796 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SHROOM2Q13796 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SHROOM2Q13796 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SHROOM2Q13796 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SHROOM2Q13796 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SHROOM2Q13796 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SHROOM2Q13796 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SHROOM2Q13796 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SHROOM2Q13796 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SHROOM2Q13796 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SHROOM2Q13796 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SHROOM2Q13796 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SHROOM2Q13796 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SHROOM2Q13796 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SHROOM2Q13796 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SHROOM2Q13796 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SHROOM2Q13796 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SHROOM2Q13796 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SHROOM2Q13796 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SHROOM2Q13796 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SHROOM2Q13796 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SHROOM2Q13796 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SHROOM2Q13796 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SHROOM2Q13796 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SHROOM2Q13796 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SHROOM2Q13796 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SHROOM2Q13796 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SHROOM2Q13796 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SHROOM2Q13796 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SHROOM2Q13796 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SHROOM2Q13796 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SHROOM2Q13796 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SHROOM2Q13796 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SHROOM2Q13796 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SHROOM2Q13796 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SHROOM2Q13796 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SHROOM2Q13796 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SHROOM2Q13796 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SHROOM2Q13796 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SHROOM2Q13796 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SHROOM2Q13796 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SHROOM2Q13796 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SHROOM2Q13796 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SHROOM2Q13796 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SHROOM2Q13796 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SHROOM2Q13796 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SHROOM2Q13796 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SHROOM2Q13796 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SHROOM2Q13796 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SHROOM2Q13796 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SHROOM2Q13796 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SHROOM2Q13796 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SHROOM2Q13796 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SHROOM2Q13796 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SHROOM2Q13796 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SHROOM2Q13796 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SHROOM2Q13796 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SHROOM2Q13796 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SHROOM2Q13796 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SHROOM2Q13796 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SHROOM2Q13796 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SHROOM2Q13796 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SHROOM2Q13796 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SHROOM2Q13796 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SHROOM2Q13796 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SHROOM2Q13796 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SHROOM2Q13796 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SHROOM2Q13796 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SHROOM2Q13796 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SHROOM2Q13796 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SHROOM2Q13796 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SHROOM2Q13796 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
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SHROOM2Q13796 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SHROOM2Q13796 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SHROOM2Q13796 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SHROOM2Q13796 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SHROOM2Q13796 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SHROOM2Q13796 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SHROOM2Q13796 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SHROOM2Q13796 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SHROOM2Q13796 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SHROOM2Q13796 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SHROOM2Q13796 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SHROOM2Q13796 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SHROOM2Q13796 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SHROOM2Q13796 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SHROOM2Q13796 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SHROOM2Q13796 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SHROOM2Q13796 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SHROOM2Q13796 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SHROOM2Q13796 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SHROOM2Q13796 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SHROOM2Q13796 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
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