Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
ATRQ13535 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
ATRQ13535 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
ATRQ13535 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
ATRQ13535 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ATRQ13535 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
ATRQ13535 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ATRQ13535 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ATRQ13535 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ATRQ13535 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ATRQ13535 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ATRQ13535 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
ATRQ13535 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ATRQ13535 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ATRQ13535 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
ATRQ13535 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ATRQ13535 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ATRQ13535 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ATRQ13535 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
ATRQ13535 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ATRQ13535 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
ATRQ13535 AC004973.1-201ENST00000413240 635 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
ATRQ13535 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
ATRQ13535 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
ATRQ13535 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
ATRQ13535 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
ATRQ13535 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
ATRQ13535 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ATRQ13535 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC12.55□□□□□ -0.4
ATRQ13535 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ATRQ13535 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ATRQ13535 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ATRQ13535 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ATRQ13535 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ATRQ13535 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ATRQ13535 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ATRQ13535 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
ATRQ13535 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ATRQ13535 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ATRQ13535 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
ATRQ13535 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ATRQ13535 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ATRQ13535 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
ATRQ13535 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
ATRQ13535 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ATRQ13535 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
ATRQ13535 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
ATRQ13535 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
ATRQ13535 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ATRQ13535 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
ATRQ13535 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
ATRQ13535 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC12.55□□□□□ -0.4
ATRQ13535 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC12.55□□□□□ -0.4
ATRQ13535 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC12.55□□□□□ -0.4
ATRQ13535 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
ATRQ13535 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ATRQ13535 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
ATRQ13535 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ATRQ13535 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ATRQ13535 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ATRQ13535 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ATRQ13535 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ATRQ13535 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
ATRQ13535 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
ATRQ13535 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
ATRQ13535 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ATRQ13535 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ATRQ13535 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ATRQ13535 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
ATRQ13535 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
ATRQ13535 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
ATRQ13535 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
ATRQ13535 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
ATRQ13535 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC12.54□□□□□ -0.4
ATRQ13535 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
ATRQ13535 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ATRQ13535 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC12.54□□□□□ -0.4
ATRQ13535 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
ATRQ13535 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ATRQ13535 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ATRQ13535 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ATRQ13535 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ATRQ13535 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ATRQ13535 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ATRQ13535 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ATRQ13535 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ATRQ13535 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
ATRQ13535 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ATRQ13535 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ATRQ13535 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
ATRQ13535 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
ATRQ13535 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
ATRQ13535 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ATRQ13535 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ATRQ13535 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ATRQ13535 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ATRQ13535 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
ATRQ13535 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
ATRQ13535 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
ATRQ13535 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC12.54□□□□□ -0.4
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