Protein–RNA interactions for Protein: Q13491

GPM6B, Neuronal membrane glycoprotein M6-b, humanhuman

Predictions only

Length 265 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPM6BQ13491 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GPM6BQ13491 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GPM6BQ13491 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GPM6BQ13491 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GPM6BQ13491 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GPM6BQ13491 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GPM6BQ13491 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GPM6BQ13491 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GPM6BQ13491 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GPM6BQ13491 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GPM6BQ13491 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GPM6BQ13491 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GPM6BQ13491 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
GPM6BQ13491 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GPM6BQ13491 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GPM6BQ13491 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GPM6BQ13491 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GPM6BQ13491 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GPM6BQ13491 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GPM6BQ13491 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GPM6BQ13491 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GPM6BQ13491 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GPM6BQ13491 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GPM6BQ13491 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GPM6BQ13491 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GPM6BQ13491 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GPM6BQ13491 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GPM6BQ13491 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GPM6BQ13491 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GPM6BQ13491 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
GPM6BQ13491 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
GPM6BQ13491 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
GPM6BQ13491 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.3
GPM6BQ13491 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
GPM6BQ13491 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
GPM6BQ13491 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GPM6BQ13491 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GPM6BQ13491 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GPM6BQ13491 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GPM6BQ13491 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GPM6BQ13491 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GPM6BQ13491 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GPM6BQ13491 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GPM6BQ13491 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GPM6BQ13491 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GPM6BQ13491 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
GPM6BQ13491 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GPM6BQ13491 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GPM6BQ13491 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GPM6BQ13491 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GPM6BQ13491 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GPM6BQ13491 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GPM6BQ13491 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GPM6BQ13491 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GPM6BQ13491 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GPM6BQ13491 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GPM6BQ13491 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GPM6BQ13491 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GPM6BQ13491 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
GPM6BQ13491 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GPM6BQ13491 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
GPM6BQ13491 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
GPM6BQ13491 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
GPM6BQ13491 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GPM6BQ13491 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GPM6BQ13491 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GPM6BQ13491 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GPM6BQ13491 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GPM6BQ13491 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GPM6BQ13491 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GPM6BQ13491 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GPM6BQ13491 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GPM6BQ13491 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GPM6BQ13491 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
GPM6BQ13491 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GPM6BQ13491 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GPM6BQ13491 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GPM6BQ13491 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GPM6BQ13491 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GPM6BQ13491 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GPM6BQ13491 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GPM6BQ13491 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GPM6BQ13491 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GPM6BQ13491 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GPM6BQ13491 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GPM6BQ13491 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GPM6BQ13491 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GPM6BQ13491 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
GPM6BQ13491 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GPM6BQ13491 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GPM6BQ13491 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GPM6BQ13491 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
GPM6BQ13491 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GPM6BQ13491 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GPM6BQ13491 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GPM6BQ13491 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GPM6BQ13491 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GPM6BQ13491 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GPM6BQ13491 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GPM6BQ13491 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms