Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 SPOCD1-201ENST00000257100 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LSAMPQ13449 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LSAMPQ13449 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
LSAMPQ13449 DLG4-203ENST00000399510 3975 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LSAMPQ13449 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LSAMPQ13449 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
LSAMPQ13449 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LSAMPQ13449 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LSAMPQ13449 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LSAMPQ13449 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LSAMPQ13449 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
LSAMPQ13449 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
LSAMPQ13449 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
LSAMPQ13449 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
LSAMPQ13449 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
LSAMPQ13449 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
LSAMPQ13449 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
LSAMPQ13449 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
LSAMPQ13449 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
LSAMPQ13449 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LSAMPQ13449 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
LSAMPQ13449 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
LSAMPQ13449 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LSAMPQ13449 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LSAMPQ13449 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LSAMPQ13449 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
LSAMPQ13449 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LSAMPQ13449 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
LSAMPQ13449 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LSAMPQ13449 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
LSAMPQ13449 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LSAMPQ13449 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LSAMPQ13449 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LSAMPQ13449 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LSAMPQ13449 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LSAMPQ13449 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LSAMPQ13449 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LSAMPQ13449 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LSAMPQ13449 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LSAMPQ13449 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LSAMPQ13449 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LSAMPQ13449 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LSAMPQ13449 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LSAMPQ13449 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LSAMPQ13449 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LSAMPQ13449 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LSAMPQ13449 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LSAMPQ13449 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LSAMPQ13449 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LSAMPQ13449 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LSAMPQ13449 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LSAMPQ13449 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LSAMPQ13449 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LSAMPQ13449 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LSAMPQ13449 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LSAMPQ13449 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LSAMPQ13449 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
LSAMPQ13449 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LSAMPQ13449 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LSAMPQ13449 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LSAMPQ13449 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LSAMPQ13449 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LSAMPQ13449 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LSAMPQ13449 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LSAMPQ13449 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LSAMPQ13449 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LSAMPQ13449 Z99774.1-201ENST00000382641 2613 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LSAMPQ13449 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LSAMPQ13449 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LSAMPQ13449 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LSAMPQ13449 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
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