Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 CCDC88A-204ENST00000413716 9586 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 YIPF6-204ENST00000462683 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 ANKH-201ENST00000284268 8203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 FEM1A-201ENST00000269856 9593 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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