Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTP4A2Q12974 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTP4A2Q12974 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTP4A2Q12974 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTP4A2Q12974 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PTP4A2Q12974 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PTP4A2Q12974 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PTP4A2Q12974 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PTP4A2Q12974 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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PTP4A2Q12974 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PTP4A2Q12974 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
PTP4A2Q12974 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTP4A2Q12974 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PTP4A2Q12974 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PTP4A2Q12974 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PTP4A2Q12974 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PTP4A2Q12974 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PTP4A2Q12974 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTP4A2Q12974 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PTP4A2Q12974 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTP4A2Q12974 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTP4A2Q12974 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTP4A2Q12974 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTP4A2Q12974 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTP4A2Q12974 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTP4A2Q12974 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PTP4A2Q12974 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTP4A2Q12974 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTP4A2Q12974 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTP4A2Q12974 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTP4A2Q12974 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTP4A2Q12974 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
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PTP4A2Q12974 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTP4A2Q12974 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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PTP4A2Q12974 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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PTP4A2Q12974 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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PTP4A2Q12974 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTP4A2Q12974 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTP4A2Q12974 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTP4A2Q12974 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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PTP4A2Q12974 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTP4A2Q12974 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTP4A2Q12974 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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PTP4A2Q12974 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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PTP4A2Q12974 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTP4A2Q12974 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTP4A2Q12974 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTP4A2Q12974 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTP4A2Q12974 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTP4A2Q12974 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTP4A2Q12974 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTP4A2Q12974 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTP4A2Q12974 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTP4A2Q12974 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTP4A2Q12974 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTP4A2Q12974 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTP4A2Q12974 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTP4A2Q12974 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTP4A2Q12974 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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