Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CGNL1Q0VF96 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CGNL1Q0VF96 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CGNL1Q0VF96 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CGNL1Q0VF96 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CGNL1Q0VF96 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CGNL1Q0VF96 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CGNL1Q0VF96 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CGNL1Q0VF96 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CGNL1Q0VF96 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CGNL1Q0VF96 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CGNL1Q0VF96 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CGNL1Q0VF96 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CGNL1Q0VF96 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CGNL1Q0VF96 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CGNL1Q0VF96 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CGNL1Q0VF96 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CGNL1Q0VF96 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CGNL1Q0VF96 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CGNL1Q0VF96 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CGNL1Q0VF96 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CGNL1Q0VF96 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CGNL1Q0VF96 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CGNL1Q0VF96 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CGNL1Q0VF96 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CGNL1Q0VF96 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CGNL1Q0VF96 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CGNL1Q0VF96 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CGNL1Q0VF96 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CGNL1Q0VF96 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CGNL1Q0VF96 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CGNL1Q0VF96 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CGNL1Q0VF96 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CGNL1Q0VF96 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CGNL1Q0VF96 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CGNL1Q0VF96 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CGNL1Q0VF96 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CGNL1Q0VF96 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CGNL1Q0VF96 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CGNL1Q0VF96 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CGNL1Q0VF96 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CGNL1Q0VF96 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CGNL1Q0VF96 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CGNL1Q0VF96 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CGNL1Q0VF96 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CGNL1Q0VF96 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CGNL1Q0VF96 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CGNL1Q0VF96 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CGNL1Q0VF96 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CGNL1Q0VF96 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CGNL1Q0VF96 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CGNL1Q0VF96 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CGNL1Q0VF96 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CGNL1Q0VF96 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CGNL1Q0VF96 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CGNL1Q0VF96 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CGNL1Q0VF96 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CGNL1Q0VF96 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CGNL1Q0VF96 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CGNL1Q0VF96 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CGNL1Q0VF96 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CGNL1Q0VF96 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CGNL1Q0VF96 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CGNL1Q0VF96 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CGNL1Q0VF96 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CGNL1Q0VF96 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CGNL1Q0VF96 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CGNL1Q0VF96 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CGNL1Q0VF96 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CGNL1Q0VF96 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CGNL1Q0VF96 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CGNL1Q0VF96 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CGNL1Q0VF96 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CGNL1Q0VF96 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CGNL1Q0VF96 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CGNL1Q0VF96 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CGNL1Q0VF96 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CGNL1Q0VF96 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CGNL1Q0VF96 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CGNL1Q0VF96 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CGNL1Q0VF96 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CGNL1Q0VF96 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CGNL1Q0VF96 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CGNL1Q0VF96 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CGNL1Q0VF96 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CGNL1Q0VF96 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CGNL1Q0VF96 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CGNL1Q0VF96 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CGNL1Q0VF96 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CGNL1Q0VF96 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CGNL1Q0VF96 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CGNL1Q0VF96 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CGNL1Q0VF96 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CGNL1Q0VF96 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CGNL1Q0VF96 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CGNL1Q0VF96 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CGNL1Q0VF96 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CGNL1Q0VF96 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CGNL1Q0VF96 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CGNL1Q0VF96 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms