Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAF6

SYCN, Syncollin, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCNQ0VAF6 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
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