Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms