Protein–RNA interactions for Protein: Q08945

SSRP1, FACT complex subunit SSRP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSRP1Q08945 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SSRP1Q08945 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
SSRP1Q08945 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SSRP1Q08945 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SSRP1Q08945 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SSRP1Q08945 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SSRP1Q08945 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SSRP1Q08945 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SSRP1Q08945 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SSRP1Q08945 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SSRP1Q08945 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SSRP1Q08945 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SSRP1Q08945 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SSRP1Q08945 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SSRP1Q08945 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SSRP1Q08945 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SSRP1Q08945 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SSRP1Q08945 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SSRP1Q08945 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SSRP1Q08945 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SSRP1Q08945 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SSRP1Q08945 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SSRP1Q08945 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SSRP1Q08945 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SSRP1Q08945 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SSRP1Q08945 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SSRP1Q08945 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SSRP1Q08945 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
SSRP1Q08945 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SSRP1Q08945 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SSRP1Q08945 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SSRP1Q08945 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SSRP1Q08945 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SSRP1Q08945 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SSRP1Q08945 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SSRP1Q08945 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SSRP1Q08945 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SSRP1Q08945 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SSRP1Q08945 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SSRP1Q08945 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SSRP1Q08945 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SSRP1Q08945 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SSRP1Q08945 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SSRP1Q08945 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SSRP1Q08945 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SSRP1Q08945 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SSRP1Q08945 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SSRP1Q08945 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SSRP1Q08945 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SSRP1Q08945 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SSRP1Q08945 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SSRP1Q08945 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SSRP1Q08945 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SSRP1Q08945 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SSRP1Q08945 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SSRP1Q08945 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SSRP1Q08945 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SSRP1Q08945 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SSRP1Q08945 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SSRP1Q08945 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SSRP1Q08945 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SSRP1Q08945 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SSRP1Q08945 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SSRP1Q08945 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SSRP1Q08945 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SSRP1Q08945 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SSRP1Q08945 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
SSRP1Q08945 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SSRP1Q08945 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SSRP1Q08945 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SSRP1Q08945 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SSRP1Q08945 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SSRP1Q08945 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SSRP1Q08945 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SSRP1Q08945 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SSRP1Q08945 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SSRP1Q08945 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SSRP1Q08945 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SSRP1Q08945 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SSRP1Q08945 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SSRP1Q08945 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SSRP1Q08945 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SSRP1Q08945 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SSRP1Q08945 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SSRP1Q08945 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SSRP1Q08945 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SSRP1Q08945 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SSRP1Q08945 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SSRP1Q08945 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SSRP1Q08945 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SSRP1Q08945 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SSRP1Q08945 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SSRP1Q08945 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SSRP1Q08945 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SSRP1Q08945 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SSRP1Q08945 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SSRP1Q08945 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SSRP1Q08945 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SSRP1Q08945 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SSRP1Q08945 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms