Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms