Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSME1Q06323 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSME1Q06323 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSME1Q06323 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSME1Q06323 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSME1Q06323 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSME1Q06323 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSME1Q06323 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PSME1Q06323 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSME1Q06323 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSME1Q06323 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSME1Q06323 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PSME1Q06323 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSME1Q06323 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSME1Q06323 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSME1Q06323 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSME1Q06323 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSME1Q06323 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSME1Q06323 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSME1Q06323 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSME1Q06323 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSME1Q06323 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSME1Q06323 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSME1Q06323 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSME1Q06323 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSME1Q06323 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSME1Q06323 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSME1Q06323 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSME1Q06323 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSME1Q06323 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSME1Q06323 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSME1Q06323 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSME1Q06323 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSME1Q06323 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSME1Q06323 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PSME1Q06323 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSME1Q06323 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSME1Q06323 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSME1Q06323 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSME1Q06323 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSME1Q06323 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSME1Q06323 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSME1Q06323 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSME1Q06323 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSME1Q06323 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSME1Q06323 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSME1Q06323 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSME1Q06323 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSME1Q06323 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSME1Q06323 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSME1Q06323 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSME1Q06323 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSME1Q06323 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSME1Q06323 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSME1Q06323 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSME1Q06323 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSME1Q06323 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSME1Q06323 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSME1Q06323 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSME1Q06323 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSME1Q06323 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSME1Q06323 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSME1Q06323 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSME1Q06323 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PSME1Q06323 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSME1Q06323 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSME1Q06323 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSME1Q06323 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSME1Q06323 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSME1Q06323 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PSME1Q06323 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSME1Q06323 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSME1Q06323 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PSME1Q06323 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSME1Q06323 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSME1Q06323 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSME1Q06323 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSME1Q06323 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PSME1Q06323 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PSME1Q06323 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSME1Q06323 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSME1Q06323 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSME1Q06323 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSME1Q06323 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSME1Q06323 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSME1Q06323 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSME1Q06323 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSME1Q06323 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSME1Q06323 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSME1Q06323 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSME1Q06323 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSME1Q06323 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSME1Q06323 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSME1Q06323 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSME1Q06323 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSME1Q06323 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSME1Q06323 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PSME1Q06323 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSME1Q06323 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSME1Q06323 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms