Protein–RNA interactions for Protein: Q05940

SLC18A2, Synaptic vesicular amine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A2Q05940 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC18A2Q05940 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC18A2Q05940 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC18A2Q05940 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC18A2Q05940 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC18A2Q05940 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC18A2Q05940 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC18A2Q05940 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC18A2Q05940 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC18A2Q05940 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC18A2Q05940 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC18A2Q05940 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC18A2Q05940 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC18A2Q05940 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC18A2Q05940 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC18A2Q05940 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC18A2Q05940 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC18A2Q05940 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC18A2Q05940 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC18A2Q05940 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms